Faute de connaissances sur la signification réelle du web profond, les fantasmes sont fréquents sur cette notion. Le web invisible ne désigne pas une zone au périmètre circonscrit, mais plutôt l’état de milliers de sites hétérogènes, dispersés dans l’univers du net. Les sites appartiennent au web profond, lorsqu’ils ne sont pas ou mal indexés par les grands moteurs de recherche, Google, Yahoo, MSN Live, Exalead et Ask.
Pour identifier des sites, plusieurs approches possibles :