Il fut à l'origine de la chaire sur "l'islamologie appliquée" à La Sorbonne et l'auteur d'une trentaine d'ouvrages traduits en plusieurs langues. L'islamologue Mohamed Arkoun (1928 - 2010) a accumulé tout au long de sa carrière un important fonds documentaire composé de 5 000 ouvrages et de 7 000 revues. A l'initiative de sa veuve Soraya Al-Yaqoubi Arkoun, présidente de la Fondation Mohamed Arkoun pour la paix entre les cultures, ce fonds vient de rejoindre la Bibliothèque nationale du royaume du Maroc (BNRM) située à Rabat.
Une convention de donation a été signée le 1er mars 2023 entre Mme Al-Yaqoubi Arkoun et Mohammed Al-Fran, directeur de la BNRM.
Un transfert depuis Paris
La bibliothèque de Mohamed Arkoun a été transférée depuis Paris où vivait l'islamologue. Docteur en philosophie de l’Université de la Sorbonne, Mohamed Arkoun a occupé le poste de professeur émérite à la Sorbonne et a enseigné les «études islamiques appliquées» dans plusieurs universités européennes, américaines et maghrébines.
A Paris, une bibliothèque située rue Mouffetard (à proximité de La Sorbonne) porte désormais son nom.